Muzaffer Baştopçu; 20 Haziran 1948'de Ankara'da doğdu.
Babasının adı Mümtaz Ömer, annesinin adı Züleyha Melahat'tır.
Yüksek Kimyager; Orta Doğu Teknik Üniversitesi Kimya Bölümünü bitirip, aynı bölümde yüksek lisansını tamamladı.
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Kimya Teknik Lisesi ve Erkek Teknik Yüksek Öğretmen Okulunda öğretim görevlisi olarak çalıştı.
Petkim Holding AŞ'de İşletme ve Proje Başmühendislikleri ile Müdür Yardımcılığı görevlerinde bulundu.
Körfez Belediye Başkanlığı ile Körfez Eğitim ve Kültür Başkanlığı yaptı.
22. ve 23. Dönem Kocaeli Milletvekili.
22 ve 23. Dönem'de NATO Parlamenter Asamblesi Türk Grubu üyeliğinde bulundu.
Halen Türk Parlamenterler Birliği Genel Başkan Yardımcılığı görevini yürütmektedir.
Çok iyi düzeyde İngilizce bilen Baştopçu, evli ve 2 çocuk babasıdır.